Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms