Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NINJ2Q9NZG7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NINJ2Q9NZG7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms