Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDND1Q9NY35 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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