Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms