Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms