Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM6Q9NX76 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM6Q9NX76 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms