Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO28Q9NVF7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms