Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC3Q9NUV7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms