Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms