Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms