Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms