Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SPHK2Q9NRA0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPHK2Q9NRA0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms