Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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LHX9Q9NQ69 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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