Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms