Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms