Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC134Q9H6E4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC134Q9H6E4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms