Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms