Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLR1EQ9GZS1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1EQ9GZS1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms