Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR12Q9C0I1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms