Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms