Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCD2Q9BXW9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms