Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms