Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF7Q9BWX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms