Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms