Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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