Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms