Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms