Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDFIP1Q9BT67 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms