Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms