Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms