Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms