Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms