Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCEEQ96PE7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCEEQ96PE7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms