Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIGD1Q96MW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD1Q96MW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms