Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms