Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA10Q969M2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA10Q969M2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms