Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-CQ95604 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms