Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms