Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOPBP1Q92547 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms