Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms