Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT6

NPLOC4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4Q8TAT6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPLOC4Q8TAT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPLOC4Q8TAT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms