Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms