Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF397Q8NF99 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms