Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms