Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms