Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC65Q8IXS2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms