Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms