Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms