Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms