Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP54Q7Z3B4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms